新鲜原料鱼和/或食用鱼边角料经煮制、压榨、干燥、粉碎加工，可制成高营养鱼粉。鱼油是煮制鱼类压榨后产生的褐色/黄色清澈液体，通常需要精炼。用作鱼粉和鱼油生产使用的鱼类可以划分为三种类型：
- 用于鱼粉和鱼油生产的体形较小的多骨整鱼；
- 人类可食用鱼类的副产品，例如鱼类边角料和内脏；
- 来自另外一种不能供人类食用的鱼类的副渔获物
用作鱼粉生产原料的捕捞整鱼主要是小型、多骨、多油、寿命短、生长快的鱼类，人类很少或根本不食用这些鱼类。鱼类切割加工产生的副产品，如边角料等越来越多地用作鱼粉和鱼油生产优质原料。许多针对鱼类资源管理的批评并不属实，原料渔场都是全球管理质量最高的渔场，都是可自然更新的资源，为全球蛋白质生产提供了有力支持。原因在于，这些鱼群通常生长快、产量高、恢复快，所以对渔业资源变化的最大影响因素是环境条件（而不是捕捞压力）。通常，这些鱼类不具有可食用的食品市场，但是可以支持人类所需的蛋白质的生产，同时鱼油也可以直接促进人类和动物健康。一般来说，鱼类捕捞都得到了有效监控和监管，确保渔业的可持续发展和长久繁荣。鱼类采用渔网捕捞，网孔尺寸由政府指定。鱼类捕捞区域和捕捞时间由政府控制，确保捕捞配额的遵守。许多渔船都装有卫星能够跟踪的跟踪器，有助于政府部门监督捕捞作业在指定区域和时间内进行。此外，渔船回港后，也会经常接受检查。渔船捕捞监控项目包括，捕捞种类、尺寸、捕捞地点和捕捞时间。
控制原料质量对确保鱼粉和鱼油质量具有关键作用，从而提高鱼粉和鱼油营养价值，实现较高价格。通常，使用冷冻海水实现鱼类冷冻保鲜，避免损失。
